A pastoral juvenil,  constitui a realização concreta da  missão educativa do colégio. É o nosso modo típico de manifestar a atenção da Igreja para com as novas gerações. Ela tem em mira o crescimento integral da pessoa e educa para o empenho por uma cidadania ativa de acordo com a idade e os níveis de estudo que o Colégio propõe.

O Sistema salesiano de ensino é fundamentado no Sistema Preventivo que é espiritualidade e método, tem sua fonte no Evangelho de João capítulo 10, 1-10 no qual, Cristo o Bom Pastor propõe a metodologia adotada por São João Bosco e Maria Mazzarello.

As Linhas Orientadoras da Missão Educativa do Instituto das FMA traduzem este sistema em conteúdo e metas, que indicam o rumo da nossa ação e inspiram uma pastoral juvenil atenta à construção da pessoa como imagem de Deus e se empenha para acompanhar os jovens para que façam escolhas responsáveis, duradouras,  capazes de dar sentido à própria vida. A Pessoa de Jesus Cristo é referência obrigatória para se chegar à elaboração de próprio projeto de vida.